Depuis huit mois, l’humanité panse ses plaies après la guerre qui a opposé la Fédération à une de ses colonies spatiales, devenue indépendante sous le nom de Duché de Zeon. Ce conflit, qui s’est figé dans un statu quo sans vainqueur ni vaincu, est pourtant loin d’être terminé, comme Amuro Ray, adolescent féru de mécanique vivant sur Side-7, va s’en apercevoir. Il découvre aussi que de son côté, la Fédération se dote d’un nouvel appareil de combat bien supérieur aux Zaku de Zeon : le Gundam.